Самодельный трансивер можно регистрировать без проблем. Порядок общий с той лишь разницей, что на него составляется акт технического осмотра общественного инспектора.
Если "разрешение" новое, т.е. свид-во о регистрации РЭС, то проблем быть не должно - можно работать на всех диапазонох там указанных. Если же старое разрешение, выданное ФГУП "РЧЦ.... округа", то тут надо смотреть срок его действия и указанные в нем частоты (если указаны вообще).
И еще, аппарат не решающий фактор для присвоения категории. Главное - умение и желание работать в эфире по 3-й категории.