Вам же указали "обратить внимание на показания ALC", если они зашкаливают, то просто сброшено усиление в предварительных каскадах вне усилителя мощности. Транзисторы скорее всего целы: если сдохли в драйвере, то мощности вообще не будет, если оконечные, то будет 5-7 Ватт. Если один в плече, то мощность будет неравномерной по диапазонам. У вас похоже загнулся переключатель мощности на мощном PIN-диоде, возможно сам диод, это чаще всего, реже мощные ключевые транзисторы по концам диода. Передатчик плохо согласован с нагрузкой, КСВ большой, вот ALC и сбрасывает мощность. Ремонт начинают с проверки постоянных напряжений на затворах и стоках транзисторов. Подключив к выходу ФНЧ передатчика 50-омную нагрузку с ГСС подают ВЧ сигнал, начиная с 25 милливольт, контролируя мощность усилителя ваттметром или следя за токами стоков, зная которые, можно подсчитать подводимую мощность. Убедившись в работоспособности усилителя, нагрузку подключают к выходу коммутатора мощности. Предварительно с помощью омметра нужно убедится в исправности PIN-диода и транзисторов, управляющих диодом. Если используете ГСС как возбудитель, будьте предельно осторожны, защита отключена и усилитель может самовозбудиться, при этом вылетают дефицитные транзисторы в драйвере! КТ921 тут не проскочат, их пробивает по коллектору высоким импульсным напряжением. Можно снизить напряжение до 15 Вольт и применить расхожие транзисторы. Вообще-то усилитель FT-1000 MARK V терпеть не может "протезов".