Правый клик мышкой на часах - меню Stay on top - галочка стоит?
Если стоит - то окно, за которым часы прячутся - правый клик по заголовку - у этого окна галочка Stay on top - галочка стоит? Если стоит - то убрать или передвинуть часы поверх того окна, у кого этой галочки нет.

