Если программа заливки работает нормально, то с вашим последовательным портом все хорошо, с кабелем связи все хорошо, проблемы с настройкой параметров последовательного порта в конкретной программе. Еще будьте уверены что вы выгружаете утилиту апдейта трансивере прежде чем пытаться конфигурировать логгер.