Ну тут тогда уже "тяжелая артиллерия" нужна.
ldd путь к исполняемому файлу
Как пример. В вашем случае с правой стороны у sqlite будет пусто.
ldd /usr/bin/python
linux-vdso.so.1 (0x00007ffef1ffc000)
libc.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6 (0x00007fcaa7ad3000)
libpthread.so.0 => /lib/x86_64-linux-gnu/libpthread.so.0 (0x00007fcaa78b4000)
libdl.so.2 => /lib/x86_64-linux-gnu/libdl.so.2 (0x00007fcaa76b0000)
libutil.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libutil.so.1 (0x00007fcaa74ad000)
libz.so.1 => /lib/x86_64-linux-gnu/libz.so.1 (0x00007fcaa7290000)
libm.so.6 => /lib/x86_64-linux-gnu/libm.so.6 (0x00007fcaa6ef2000)
/lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x00007fcaa845f000)
Може еще запустить через "strace путь_программы | grep sqlite" и вдруг получится выудить путь где он ожидает эту библиотеку. В бородатые времена такое решалось симлинками на библиотеки.
Второй вариант понять, с использованием какого framework написана программа. Возможно нужно поставить какой qtsqlite или gtk. Но тут вообще не спец.