1. Обязательно сделайте бакап лога и настроек. Это не только при обновлении, это нужно делать всегда.
2. Просто ставите новую версию поверх старой. Если предыдущая версия у Вас была не слишком древняя - проблем вообще быть не должно, если достаточно старая - то какие то настройки придется произвести - те, что не были в старой версии.
- - - Добавлено - - -
А какие там настройки? Драйвера установили? Должен появиться виртуальны ком-порт (по нему CAT) и звуковая карта. Все. Больше ничего не делал. А родная программа управления TS-590 работает? Она лучшая проверка того, что все работает Ок!