Василий, привет! С Новым Годом!
Входное и выходное реле включаются одновременно. Оба реле управляются одним транзистором. Выходное все же опережает немножко, потому что его включение форсировано RC цепочкой (R5/C6 на плате Интерфейс).
Антенное реле никогда не переключает под нагрузкой. Поэтому искреж там не очень вероятный. Обычно искреж в антенне, кабелях, разъемах. Экспериментальным путем надо установит где точно. Если в в усилителе, лучше найти и отстранит причина, чем отключат защиты. Не хочется превратит усилителя в ВЧ сварочного аппарата или плазменного резака, hi...