Понятно! Вот в чем собака порылась:
Disable radio poling when keying - CAT перестает работать, когда начинает работать ключ, вот по этому и можно задействовать линию RTS!
В принципе решение нормальное для обычных трансиверов, а вот для ExpertSDR'а боюсь не самое лучшее решение...
По этому если Вам хочется именно 1 порт использовать - сейчас можно DTR - выбрать для CW, а PTT via CAT указать в логе. Это существенно лучше будет для ExpertSDR.