Да, различие есть. Считается , что, используя трансформатор с гальванически несвязанными обмотками можно не ставить заградительный дроссель на кабель в точке питания антенны, т.к. такое исполнение исключает эфект фидера, но это теоретически. А дроссель хоть после трансивера ставить, но нужно.